首先對湖北襄陽和恩施地區(qū)的健康老年人腸道乳酸菌進(jìn)行分離與鑒定,然后從中選擇發(fā)酵乳桿菌(Lactobacillus fermentum)進(jìn)行多位點序列分型(multilocus sequence typing,MLST)分析。結(jié)果顯示,基于可培養(yǎng)方法,湖北襄陽與恩施地區(qū)老年人腸道乳酸菌可以鑒定為以乳桿菌屬(Lactobacillus)為主的5 個菌屬,15 個種。總的來說,發(fā)酵乳桿菌和唾液乳桿菌(L. salivarius)占老年人腸道源乳酸菌分離株總量的55%左右,表明人體腸道可以作為發(fā)酵乳桿菌的重要分離來源。基于8 個持家基因的MLST分析表明,25 株來源于腸道的發(fā)酵乳桿菌可以劃分為25 個序列型,具有極高的遺傳多樣性;基于選擇壓力分析與phi-test,選用的8 個持家基因均受到純化選擇作用,且其中僅基因rpoB顯著經(jīng)歷了基因重組事件;另外,基于Prim’s和goeBURST的進(jìn)化分析表明,一半左右的腸道源發(fā)酵乳桿菌傾向于形成單獨的分支,表明它們具有一定的宿主特異性,可能的原因是為適應(yīng)腸道環(huán)境,這些發(fā)酵乳桿菌經(jīng)歷了有異于發(fā)酵食品生境的進(jìn)化歷程。
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