領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
應(yīng)用本實(shí)驗(yàn)室編寫的perl 程序包將GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)中乳酸菌生長(zhǎng)、應(yīng)激代謝相關(guān)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和相應(yīng)的基因組數(shù)據(jù)整合，構(gòu)建易于本地查詢和訪問(wèn)的MySQL 數(shù)據(jù)庫(kù)，利用該數(shù)據(jù)庫(kù)研究乳酸菌在生長(zhǎng)、衰亡及應(yīng)對(duì)不利環(huán)境(如膽鹽、過(guò)氧化氫、碳氮源饑餓)時(shí)的轉(zhuǎn)錄組特征，并利用MEME 軟件尋找到了各種情況下部分協(xié)同表達(dá)基因前導(dǎo)序列的共有motif，即潛在的調(diào)控蛋白作用位點(diǎn)。結(jié)果表明：除了膽汁和草酸銨對(duì)嗜酸乳桿菌細(xì)胞代謝特征的影響具有較高的一致性外，面對(duì)其他壓力環(huán)境乳酸菌細(xì)胞的應(yīng)激模式具有較大的差異，有著各自受到特異性誘導(dǎo)表達(dá)或抑制的基因群，但在各種情況下翻譯(J)、脂類運(yùn)輸和代謝(I)、細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸和分泌(U)相關(guān)因的轉(zhuǎn)錄水平變化都比較顯著，特別是蛋白質(zhì)翻譯相關(guān)基因變化最為明顯，說(shuō)明細(xì)胞主要通過(guò)調(diào)控蛋白質(zhì)翻譯相關(guān)基因的種類和表達(dá)量來(lái)對(duì)細(xì)胞的狀態(tài)進(jìn)行調(diào)整。
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