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核桃中主要過敏原Jug r 1 B細胞線性表位中關(guān)鍵氨基酸的免疫信息學預測和識別
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 145 發(fā)表時間: 2021-12-07
作者: 郝夢真,畢源,宋若琳,陳錫,車會蓮
關(guān)鍵詞: 核桃;Jug r 1;關(guān)鍵氨基酸;線性表位;免疫信息學
摘要:

為確定影響Jug r 1線性表位致敏性的關(guān)鍵氨基酸,研究2 種免疫信息學方法預測Jug r 1線性表位關(guān)鍵氨基酸的準確率和效率,以進一步認識核桃主要過敏原Jug r 1的B細胞線性表位。本研究通過2 種免疫信息學的方法對Jug r 1中3 個線性表位上的關(guān)鍵氨基酸進行預測,采用丙氨酸掃描誘變法對關(guān)鍵氨基酸進行識別,采用固相合成技術(shù)合成Jug r 1系列突變多肽,以部分中國核桃過敏患者血清為探針,識別Jug r 1關(guān)鍵氨基酸。結(jié)果表明:表位1(4LVALLFVANAAA15)中的第4位亮氨酸、第7位亮氨酸、第8位亮氨酸和表位2(16FRTTITTMEIDEDID30)中的第20位異亮氨酸、第21位蘇氨酸、第22位異亮氨酸以及表位3(125CGISSQRCEIRRSWF139)中的第127位異亮氨酸、第129位絲氨酸、第130位谷氨酰胺為關(guān)鍵氨基酸。使用兩種免疫信息學結(jié)合預測的關(guān)鍵氨基酸準確率達到100%,但預測效率僅為11%。因此,使用2 種免疫信息學結(jié)合的方式預測表位關(guān)鍵氨基酸可提高準確性,但會忽略一些關(guān)鍵氨基酸。免疫信息學結(jié)合丙氨酸掃描誘變法是識別表位關(guān)鍵氨基酸的重要研究思路。

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