原標(biāo)題：中外學(xué)者破譯香菜基因組序列并搭建數(shù)據(jù)共享平臺(tái)

記者4月3日從華北理工大學(xué)獲悉，該校科研人員與加拿大農(nóng)業(yè)與農(nóng)業(yè)食品部、美國(guó)佐治亞大學(xué)的研究人員合作，解析了國(guó)際上首個(gè)香菜基因組序列，相關(guān)論文發(fā)表在《植物生物技術(shù)期刊》。基于香菜、胡蘿卜等傘形科物種基因組序列，研究人員搭建了香菜等傘形科作物多組學(xué)數(shù)據(jù)共享及分析平臺(tái)（http://cgdb.bio2db.com/），相關(guān)論文4月1日刊登于《園藝研究》雜志。

香菜，學(xué)名芫荽，是園藝類作物傘形科非常重要的一員，作為一種調(diào)味用的蔬菜類作物，在人們的日常生活中被廣泛食用。

“每個(gè)人含有的嗅覺基因不同，基因?qū)θ╊愇镔|(zhì)非常敏感，而香菜中含有大量的醛類物質(zhì)，因此造成了人們對(duì)香菜的喜好程度大相徑庭。”該論文的通訊作者、華北理工大學(xué)教授王希胤告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》。

香菜還具有極其重要的藥用價(jià)值，美國(guó)加州大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)，香菜中富含十二烯醛，該物質(zhì)能與鉀通道的特定部分結(jié)合并打開它們，進(jìn)而降低細(xì)胞的興奮性，揭示了民間自古以來使用香菜治療癲癇的分子機(jī)制。此外，研究表明香菜還具有抗癌、消炎、抗真菌細(xì)菌、保護(hù)心臟以及鎮(zhèn)痛等作用。除香菜外，傘形科還包括許多非常重要的蔬菜作物及中藥材，如胡蘿卜、芹菜、茴香、孜然、柴胡、當(dāng)歸和明黨參等。

“搭建香菜等傘形科作物多組學(xué)數(shù)據(jù)共享及分析平臺(tái)，是課題組在成功破譯香菜基因組后，在傘形科作物領(lǐng)域取得的又一重要研究成果。”王希胤告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》，該平臺(tái)整合了大部分傘形科物種的基因組、轉(zhuǎn)錄組和代謝組學(xué)數(shù)據(jù)，提供了多個(gè)分析工具，以方便科研人員查詢、比對(duì)和下載數(shù)據(jù)。平臺(tái)可供研究人員免注冊(cè)使用，并且會(huì)持續(xù)更新。

“該研究搭建的傘形科多組學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)具有非常重要的意義。”論文第一作者宋小明介紹，該平臺(tái)不僅為傘形科作物的進(jìn)化及比較基因組學(xué)研究提供了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)資源，而且也為傘形科作物的分子遺傳育種提供了豐富的基因資源，具有重要的理論指導(dǎo)意義和應(yīng)用價(jià)值。

專家表示，傘形科含有許多重要的物種，為人類提供了豐富的食材和藥用成分，該研究將極大地推進(jìn)傘形科作物比較基因組學(xué)和功能基因組學(xué)的研究進(jìn)程。

相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41438-020-0261-0

https://doi.org/10.1111/pbi.13310

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