采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-deformation gradient gel electrophoresis analysis,PCR-DGGE)技術(shù)研究3 種包裝(空氣、真空、氣調(diào))結(jié)合鈷60輻照技術(shù)對(duì)魚(yú)肉表面優(yōu)勢(shì)菌菌群的影響,分別選擇6 種輻照劑量(0、2、4、6、8、10 kGy)照射4 ℃貯藏18 d后的魚(yú)肉表面優(yōu)勢(shì)腐敗菌群進(jìn)行研究。方法:采集第18天不同包裝不同劑量的草魚(yú)肉樣品,洗脫魚(yú)肉表面菌;提取DNA,擴(kuò)增16S rDNA的V3可變區(qū),用PCRDGGE技術(shù)鑒定優(yōu)勢(shì)菌,割膠回收測(cè)序。結(jié)果表明:不同包裝魚(yú)肉表面優(yōu)勢(shì)菌群數(shù)量和種類(lèi)不同,在樣品中共同的優(yōu)勢(shì)腐敗菌為假單胞菌,在空氣包裝中優(yōu)勢(shì)腐敗菌是假單胞菌、乳酸菌和沙雷菌,沙雷菌在輻照劑量高于8 kGy時(shí)被抑制。在真空包裝中優(yōu)勢(shì)腐敗菌是假單胞菌、沙雷菌、熱死環(huán)絲菌和耶爾森菌,沙雷菌輻照劑量高于6 kGy時(shí)被抑制,而耶爾森菌在2 kGy以上即被抑制,熱死環(huán)絲菌在6、8 kGy輻照條件下才出現(xiàn),其具有很高的輻照抗性。在氣調(diào)包裝中優(yōu)勢(shì)腐敗菌是假單胞菌和乳酸菌,但乳酸菌僅在氣調(diào)包裝2 kGy輻照和氣調(diào)包裝8 kGy兩種輻照包裝條件下是優(yōu)勢(shì)腐敗菌。結(jié)果表明,PCR-DGGE技術(shù)可以很好地鑒別魚(yú)肉表面優(yōu)勢(shì)腐敗菌。
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