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變性梯度凝膠電泳法初步解析茯磚茶渥堆發(fā)酵過程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 120 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 劉石泉,胡治遠(yuǎn),趙運(yùn)林
關(guān)鍵詞: 茯磚茶;渥堆發(fā)酵;變性梯度凝膠電泳;細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)
摘要:

為解析茯磚茶渥堆發(fā)酵過程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和種類,對渥堆過程中不同時(shí)間段細(xì)菌16S rDNA 的V3可變區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,對細(xì)菌變性梯度凝膠電泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)圖譜中條帶進(jìn)行克隆、測序和序列比對。結(jié)果表明:黑毛茶在渥堆過程中以渥堆24 h為分界點(diǎn),前后各自細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似,但前后的差異較大;從16S rDNA 的V3可變區(qū)比對結(jié)果證明黑毛茶渥堆過程中有諾卡氏菌屬、新鞘脂菌屬、短波單胞菌屬、韋龍氏假單胞菌屬、突那梭菌屬、克雷伯氏菌屬、乳桿菌屬及不可培養(yǎng)的ε-變形菌、腐敗螺旋菌屬、黏球菌屬、根瘤菌屬和未知分類地位的不可培養(yǎng)細(xì)菌6 種。采用DGGE指紋圖譜能更全面、更真實(shí)地反映黑毛茶渥堆發(fā)酵過程中細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)和多樣性變化。

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