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花生過敏原Ara h 2.02 二級結(jié)構(gòu)和B 細(xì)胞抗原表位預(yù)測
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 127 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 胡純秋,高金燕,羅春萍,陳紅兵
關(guān)鍵詞: Ara h 2.02|花生過敏|二級結(jié)構(gòu)|B 細(xì)胞表位
摘要:

為預(yù)測花生過敏原Ara h 2.02 的二級結(jié)構(gòu)和B 細(xì)胞抗原表位,通過Genbank 數(shù)據(jù)庫搜索到Ara h 2.02 基因,并推導(dǎo)出其相應(yīng)的氨基酸序列,采用SOPMA 和DNAStar 軟件預(yù)測該蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)以及通過Jameson-Wolf 法、Kyte-Doolittle 法、Emini 法和Karplus-Schulz 法分別預(yù)測其抗原指數(shù)、親水性、表面可性、柔韌性等參數(shù),并綜合分析預(yù)測該蛋白的B 細(xì)胞抗原表位。結(jié)果表明:在序列28~31、56~73、76~90、92、148、156~158、168~169 區(qū)域最可能是Ara h 2.02 蛋白的B 細(xì)胞抗原表位的優(yōu)勢區(qū)域。該結(jié)果將為尋找Ara h 2.02 的最佳優(yōu)勢表位提供支持,同時為該蛋白單克隆抗體的制備等研究提供理論依據(jù)。

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