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隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù)在沙門氏菌同源性分析中的應(yīng)用
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 157 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 郭愛玲, 謝躋, 粟婉媛, 王洪江, 柳婷, 汪勝, 馬美湖
關(guān)鍵詞: 沙門氏菌; 地方菌株; RAPD; 聚類分析; 同源性;
摘要:

目的:利用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù)(random amplified polymorphicDNA,RAPD)對(duì)從食品、蛋品樣本或從業(yè)人員中收集到的67個(gè)地方菌株、4個(gè)模式菌株,涉及29種血清型的沙門氏菌進(jìn)行同源性分析,為沙門氏菌食源性疾病的流行病學(xué)溯源和疫情控制提供理論依據(jù)。方法:選用篩選得到的10個(gè)堿基引物(CCGAAGCTGC)運(yùn)用RAPD技術(shù)對(duì)不同來源的71株沙門氏菌進(jìn)行隨即引物擴(kuò)增,得到的RAPD圖譜使用NTSYS-pc2.10e軟件進(jìn)行聚類分析。結(jié)果:相似性系數(shù)在0.70時(shí),71株沙門氏菌可以分為七大類群,其中最多的一群內(nèi)聚集的菌株達(dá)54株,相似性系數(shù)在0.90時(shí),可以分為26個(gè)群,最多的一群內(nèi)聚集的菌株達(dá)18株,相似性系數(shù)為1.00時(shí),有9個(gè)組群,最多的一組群內(nèi)聚集的菌株達(dá)11。同源性結(jié)果和血清學(xué)鑒定的結(jié)果有90%的吻合率。結(jié)論:RAPD檢測技術(shù)可以用于沙門氏菌食源性疾病的流行病學(xué)調(diào)查和溯源。

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