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基于高通量測序技術(shù)對浙江傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜微生物多樣性的解析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 135 發(fā)表時(shí)間: 2021-04-09
作者: 鮑偉,韓姣姣,張旨軒,蘆晨陽,周君,明庭紅,李曄,蘇秀榕
關(guān)鍵詞: 傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜;酸筍和酸茭白;16S rDNA高通量測序;微生物多樣性
摘要:

以浙江地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜臭冬瓜、臭莧菜梗、酸筍和酸茭白為研究對象,采用Illunina MiSeq高通量測序技術(shù),分別分析浙江傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜的汁液、固形物和培養(yǎng)物中細(xì)菌和真菌微生物群落組成和多樣性,探討“臭”和“酸”類發(fā)酵食品的微生物群落組成差異。結(jié)果表明:14 個(gè)樣品中細(xì)菌和真菌的測序覆蓋率分別為0.97和0.99。分析細(xì)菌,臭莧菜梗固形物的可操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU)最多、Shannon指數(shù)最高;而酸筍固形物中的OTU最少,酸筍汁的Shannon指數(shù)最低;且臭莧菜梗汁、固形物和培養(yǎng)物以及酸筍固形物和培養(yǎng)物的菌群結(jié)構(gòu)更為接近。分析真菌,臭冬瓜培養(yǎng)物和酸茭白固形物中的真菌OTU最多,臭莧菜梗培養(yǎng)物中的OTU最少,而酸茭白汁中沒有檢測出真菌;酸筍汁的Shannon指數(shù)最高,臭莧菜梗培養(yǎng)物的Shannon指數(shù)最低;除鹵水、臭莧菜梗汁和酸筍樣品外其余樣品的真菌群落組成更為接近。在屬水平,臭冬瓜培養(yǎng)物、酸筍汁、酸筍固形物和酸茭白汁的優(yōu)勢細(xì)菌屬分別為脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、埃希菌屬(Escherichia)和Caproiciproducens,鹵水培養(yǎng)物、酸茭白固形物和培養(yǎng)物的優(yōu)勢細(xì)菌屬為梭菌屬(Clostridium),臭莧菜梗汁、固形物和培養(yǎng)物的優(yōu)勢細(xì)菌屬為擬桿菌屬(Bacteroides),鹵水、臭冬瓜汁和固形物的優(yōu)勢細(xì)菌屬為乳酸桿菌屬(Lactobacillus);鹵水的優(yōu)勢真菌屬為柯達(dá)酵母屬(Kodamaea),臭莧菜梗汁、固形物和培養(yǎng)物的優(yōu)勢真菌屬為假絲酵母屬(Candida),而其他樣品的優(yōu)勢真菌屬為Leptospora。

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