領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
目的：研發(fā)安全、高效、具有新型作用靶點(diǎn)的殺菌劑，在對(duì)指狀青霉（Penicillium digitatum）VmaH和PMA進(jìn)行生物信息學(xué)和表達(dá)模式分析的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步探討兩個(gè)基因作為潛在殺菌作用靶點(diǎn)的可能性。方法：以指狀青霉為實(shí)驗(yàn)材料，使用Pfam、MEGA 5.0等在線軟件對(duì)VmaH和PMA的編碼蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析，進(jìn)一步利用實(shí)時(shí)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)分析VmaH和PMA在指狀青霉中的表達(dá)規(guī)律。結(jié)果：結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)，VmaH具有2 個(gè)非常保守的結(jié)構(gòu)域，分別為N端結(jié)構(gòu)域和C端結(jié)構(gòu)域；PMA具有3 個(gè)非常保守的結(jié)構(gòu)域，分別為N端結(jié)構(gòu)域、E1-E2 ATPase結(jié)構(gòu)域和水解酶結(jié)構(gòu)域。同源比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)真菌物種中VmaH和PMA的氨基酸相似度分別為79%、80%，表明不同真菌間VmaH和PMA高度保守。進(jìn)化樹(shù)分析顯示指狀青霉VmaH和PMA與青霉屬和曲霉屬的VmaH和PMA具有較近的親緣關(guān)系。相較于PMA，VmaH在指狀青霉的整個(gè)生長(zhǎng)過(guò)程中一直保持較高的表達(dá)水平，而PMA的基因表達(dá)水平在指狀青霉生長(zhǎng)后期顯著下調(diào)。葡萄糖饑餓顯著降低了VmaH和PMA的基因表達(dá)水平，葡萄糖回補(bǔ)可以恢復(fù)兩個(gè)基因的表達(dá)水平，尤其是VmaH的表達(dá)量會(huì)顯著上調(diào)。極酸極堿條件下VmaH和PMA的表達(dá)量均顯著下調(diào)，弱酸和弱堿性環(huán)境使PMA基因的表達(dá)量增加。氧化、還原劑處理均能顯著降低VmaH和PMA的表達(dá)水平，且PMA的下調(diào)尤為顯著。PMA在不同殺菌劑處理?xiàng)l件下表達(dá)量均顯著下降；而VmaH對(duì)不同殺菌劑處理的響應(yīng)有所差異。結(jié)論：通過(guò)VmaH和PMA的生物信息學(xué)和表達(dá)規(guī)律分析，可以將VmaH和PMA所編碼的蛋白作為指狀青霉?jié)撛跉⒕饔冒悬c(diǎn)進(jìn)行深入研究。
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