目的:建立A群輪狀病毒(rotavirus,RV)一步法反轉(zhuǎn)錄微滴式數(shù)字聚合酶鏈式反應(reverse transcriptase droplet digital polymerase chain reaction,RT-ddPCR)方法。方法:篩選特異性引物探針,建立并優(yōu)化一步法RT-ddPCR方法,確定特異性;制備含A群RV目的片段的RNA標準物質(zhì),確定建立方法的檢測限、準確度、重復性和復現(xiàn)性。A群RV陽性糞便樣品梯度稀釋后制作染毒液,制備人工染毒樣品,分離病毒與食品基質(zhì),濃縮得到病毒懸液,提取RNA后,比較不同食品基質(zhì)中一步法RT-ddPCR檢測結(jié)果。結(jié)果:建立的一步法RT-ddPCR方法定量限為58 000.00~5.80 拷貝/μL,具有良好的特異性、準確性、靈敏度、重復性和復現(xiàn)性。各染毒水平下A群RV檢出量和回收率在不同食品基質(zhì)中存在顯著性差異(P<0.05)。結(jié)論:研究建立的一步法RT-ddPCR方法可準確定量A群RV RNA,食品基質(zhì)可影響一步法RT-ddPCR檢測結(jié)果,通過病毒回收率可計算食品中A群RV的實際載量。
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