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高通量測序分析大頭菜發(fā)酵過程中真菌的多樣性
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 131 發(fā)表時間: 2020-05-25
作者: 吳進菊,曾瑞萍,張俊毅,張一舟,余海忠,于博
關(guān)鍵詞: 大頭菜;發(fā)酵;真菌多樣性;高通量測序
摘要:

為全面揭示大頭菜發(fā)酵過程中真菌群落結(jié)構(gòu)動態(tài)變化,采用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)對不同發(fā)酵時期工廠生產(chǎn)的大頭菜發(fā)酵液進行真菌多樣性研究。經(jīng)可操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)分析,24 份樣品中共發(fā)現(xiàn)4 個門、19 個綱、56 個目、106 個科、190 個屬、303 個種、516 個OTU。通過聚類分析和主成分分析發(fā)現(xiàn),24 個樣品可根據(jù)真菌群落結(jié)構(gòu)特征劃分為3 個聚類,將發(fā)酵的整個過程分為發(fā)酵前期、中期和后期,3 個發(fā)酵階段共有OTU數(shù)為124 個。去除未分類的真菌后,所有樣品中的優(yōu)勢菌門均為子囊菌門,相對豐度達到74.2%~99.8%,其次為擔子菌門。目水平上,發(fā)酵前期炭角菌目為優(yōu)勢菌目,相對豐度為45.7%~60.2%,后續(xù)發(fā)酵過程中,酵母目取代炭角菌目,占據(jù)了絕對優(yōu)勢,相對豐度達到63.6%~99.5%。屬水平上,發(fā)酵前期明梭孢屬(Monographella)為優(yōu)勢菌屬,發(fā)酵中期和后期德巴利氏酵母屬(Debaryomyces)和接合酵母屬(Zygosaccharomyces)為優(yōu)勢菌屬。

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