采用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)研究襄陽大頭菜發(fā)酵過程中細菌多樣性和菌群結(jié)構(gòu)的動態(tài)變化。結(jié)果表明,24 份大頭菜發(fā)酵液樣本共檢測出19 個門、32 個綱、67 個目、133 個科、293 個屬、482 個種、658 個可操作分類單元。在整個發(fā)酵過程中,變形菌門和厚壁菌門占據(jù)了絕對的優(yōu)勢,相對豐度分別為26.14%~78.12%和8.33%~70.12%。屬水平上,鹽厭氧菌屬(Halanaerobium)、弧菌屬(Vibrio)、鹽單胞菌屬(Halomonas)、乳桿菌屬(Lactobacillus)和色鹽桿菌屬(Chromohalobacter)5 個細菌屬為優(yōu)勢菌屬,在發(fā)酵過程中此消彼長。通過聚類分析和主成分分析發(fā)現(xiàn),24 個樣本可根據(jù)細菌群落結(jié)構(gòu)特征劃分為2 個聚類,將發(fā)酵的整個過程分為發(fā)酵前期和后期。本研究揭示了襄陽大頭菜發(fā)酵過程中細菌群落結(jié)構(gòu)的動態(tài)演替,為今后大頭菜生產(chǎn)的改進提供一定的研究基礎(chǔ)。
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