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基于宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)對(duì)豆醬中活菌群落分析方法的建立
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 114 發(fā)表時(shí)間: 2020-03-02
作者: 安飛宇,武俊瑞,尤升波,解夢(mèng)汐,陳旭,趙越,包海燕,烏日娜
關(guān)鍵詞: 宏轉(zhuǎn)錄組學(xué);豆醬;活菌;群落結(jié)構(gòu);功能注釋
摘要:

基于宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)建立分析自然發(fā)酵豆醬中活菌群落的方法,并對(duì)比分析豆醬在發(fā)酵初期和末期的活菌群落結(jié)構(gòu)及功能。通過比較,確立在4 ℃、8 000 r/min離心5 min后棄上清液的樣品預(yù)處理方法,其所提取的RNA質(zhì)量濃度、純度和總量更高。高通量測(cè)序結(jié)果表明,細(xì)菌在醬醪發(fā)酵階段起主導(dǎo)作用,主要的細(xì)菌屬為四聯(lián)球菌屬(Tetragenococcus)和乳桿菌屬(Lactobacillus)。真菌僅在發(fā)酵初期有一定豐度,發(fā)酵末期時(shí)豐度很低。菌群功能主要集中在碳水化合物和氨基酸的代謝,且大多富集在發(fā)酵末期。研究結(jié)果在物種和功能層面上具有一致性,為揭示豆醬發(fā)酵過程中真正發(fā)揮作用的微生物和優(yōu)良發(fā)酵菌種的選育提供新的研究方法和技術(shù)支持。

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