本研究對(duì)19 株彎曲乳桿菌(Latilactobacillus curvatus)和40 株清酒乳桿菌(L. sakei)的基因組進(jìn)行了比較分析。平均核苷酸同一性及全基因組共線性分析表明,L. curvatus和L. sakei基因組間的核酸序列同源性較弱,可作為區(qū)分兩個(gè)物種的指標(biāo)。對(duì)兩個(gè)物種分別構(gòu)建泛基因組,并對(duì)泛基因組中的核心基因功能進(jìn)行注釋。結(jié)果顯示,L. curvatus和L. sakei各自的核心基因組主要涉及菌株的基礎(chǔ)代謝。對(duì)菌株個(gè)體基因組的比對(duì)分析發(fā)現(xiàn):1)L. curvatus與L. sakei均含有廣泛的糖苷水解酶類編碼基因,在分解和代謝膳食纖維類多糖、乳糖利用以及木質(zhì)纖維素中具有豐富的基因資源;2)3 個(gè)菌株含抗生素耐藥性基因,且來源于基因橫向轉(zhuǎn)移;3)L. sakei特有的精氨酸脫亞胺酶途徑、L. curvatus中的絲氨酸脫水酶途徑及鳥嘌呤脫氨酶途徑,以及個(gè)別菌株中谷氨酸脫羧酶的發(fā)掘,揭示了這兩類菌不同的抗酸機(jī)制;4)冷應(yīng)激蛋白編碼基因的發(fā)現(xiàn)也賦予了這兩類菌良好的冷加工特性。此外,部分L. sakei基因組中含有編碼lactocin S及凝結(jié)素相關(guān)的基因簇。總之,本研究通過對(duì)L. curvatus及L. sakei進(jìn)行基因組水平的比較和分析,提供了兩個(gè)物種之間的分類標(biāo)準(zhǔn)以及菌株個(gè)體上的差異信息,為這兩種乳酸菌的生理生化分子遺傳機(jī)制研究以及工業(yè)應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。
2023年第44卷 2022年第43卷 2021年第42卷 2020年第41卷 2019年第40卷 2018年第39卷 2017年第38卷 2016年第37卷 2015年第36卷 2014年第35卷 2013年第34卷 2012年第33卷 2011年第32卷 2010年第31卷 2009年第30卷 2008年第29卷 2007年第28卷 2006年第27卷 2005年第26卷 2004年第25卷 2003年第24卷 2002年第23卷 2001年第22卷 2000年第21卷 1999年第20卷 1998年第19卷 1997年第18卷 1996年第17卷 1995年第16卷 1994年第15卷 1993年第14卷 1992年第13卷 1991年第12卷 1990年第11卷 1989年第10卷 1988年第09卷 1987年第08卷 1986年第07卷 1985年第06卷 1984年第05卷 1983年第04卷 1982年第03卷 1981年第02卷 1980年第01卷
電話: 010-87293157
地址: 北京市豐臺(tái)區(qū)洋橋70號(hào)
版權(quán)所有 @ 2023 中國(guó)食品雜志社 京公網(wǎng)安備11010602060050號(hào) 京ICP備14033398號(hào)-2