為了詳細解析枯草芽孢桿菌SNBS-3的基因組特征,本研究在前期研究基礎上,采用Illumina二代測序技術和第三代高通量Pacbio測序平臺,對從傳統豆醬中篩選得到的枯草芽孢桿菌SNBS-3進行全基因組測序,獲得菌株基因組特征信息、基因功能注釋及分類、系統發(fā)育進化和次級代謝產物等關鍵信息。結果表明:SNBS-3的基因組為一條環(huán)狀閉合DNA,大小為4 076 387 bp,共有4 000 個蛋白質編碼基因,在直系同源集、基因本體論、京都基因與基因組百科全書、碳水化合物活性酶、抗生素耐藥性數據庫和致病毒力因子數據庫分別注釋到3 209、2 824、2 560、147、12 個和4 個功能基因。應用在線軟件AntiSMASH和Bagel4發(fā)現其除具有合成Surfactin、Mycosubtilin、Plipastatin、Bacilysin和Bacillaene等多種抑菌物質的相關基因外,還具有一條完整的細菌素Subtilosin A合成基因簇,結合抑菌實驗和蛋白酶K實驗結果推測枯草芽孢桿菌SNBS-3具有合成細菌素Subtilosin A的能力。綜上,枯草芽孢桿菌SNBS-3全基因組測序結果表明其本身可產生多種抑菌物質,是1 株具有生防潛力的微生物,相關分析結果可為包括細菌素Subtilosin A在內的多種抑菌物質的進一步開發(fā)應用提供理論基礎。
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