領學術科研之先,創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
期刊集群
枯草芽孢桿菌SNBS-3全基因組測序及其抑菌物質預測分析
來源:導入 閱讀量: 283 發(fā)表時間: 2024-02-20
作者: 紀帥奇,烏日娜,張?zhí)葬耍瑠鋲粞∪鹧R穎,武俊瑞
關鍵詞: 枯草芽孢桿菌;全基因組;細菌素;合成基因簇;
摘要:

為了詳細解析枯草芽孢桿菌SNBS-3的基因組特征,本研究在前期研究基礎上,采用Illumina二代測序技術和第三代高通量Pacbio測序平臺,對從傳統豆醬中篩選得到的枯草芽孢桿菌SNBS-3進行全基因組測序,獲得菌株基因組特征信息、基因功能注釋及分類、系統發(fā)育進化和次級代謝產物等關鍵信息。結果表明:SNBS-3的基因組為一條環(huán)狀閉合DNA,大小為4 076 387 bp,共有4 000 個蛋白質編碼基因,在直系同源集、基因本體論、京都基因與基因組百科全書、碳水化合物活性酶、抗生素耐藥性數據庫和致病毒力因子數據庫分別注釋到3 209、2 824、2 560、147、12 個和4 個功能基因。應用在線軟件AntiSMASH和Bagel4發(fā)現其除具有合成Surfactin、Mycosubtilin、Plipastatin、Bacilysin和Bacillaene等多種抑菌物質的相關基因外,還具有一條完整的細菌素Subtilosin A合成基因簇,結合抑菌實驗和蛋白酶K實驗結果推測枯草芽孢桿菌SNBS-3具有合成細菌素Subtilosin A的能力。綜上,枯草芽孢桿菌SNBS-3全基因組測序結果表明其本身可產生多種抑菌物質,是1 株具有生防潛力的微生物,相關分析結果可為包括細菌素Subtilosin A在內的多種抑菌物質的進一步開發(fā)應用提供理論基礎。

電話: 010-87293157 地址: 北京市豐臺區(qū)洋橋70號

版權所有 @ 2023 中國食品雜志社 京公網安備11010602060050號 京ICP備14033398號-2

贵定县| 资中县| 利辛县| 米易县| 宁乡县| 肇源县| 万载县| 仁寿县| 灵丘县| 龙南县| 东至县| 巍山| 浮梁县| 常熟市| 大名县| 镇雄县| 潜江市| 黄浦区| 湖北省| 东兴市| 雷山县| 利津县| 梁平县| 朔州市| 滕州市| 黄冈市| 伊金霍洛旗| 合水县| 清徐县| 连江县| 衡山县| 雷波县| 锡林浩特市| 汪清县| 布拖县| 长岛县| 双峰县| 泸西县| 山东省| 大姚县| 隆昌县|