通過構(gòu)建牛熱休克蛋白A6(heat shock protein A6,HSPA6)序列與其他生物的系統(tǒng)進(jìn)化樹,以及運(yùn)用生物信息學(xué)方法分析牛HSPA6蛋白的基本理化性質(zhì)、親疏水性等,并結(jié)合蛋白互作網(wǎng)絡(luò),探究牛HSPA6基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能特性。結(jié)果顯示,牛HSPA6蛋白與羊、長江江豚等哺乳動物的氨基酸序列相似性較高;牛HSPA6蛋白分子質(zhì)量為70 570.64 u,理論等電點(diǎn)為5.66,為酸性親水性蛋白,無跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽;可能存在11 個得分>0.900的磷酸化位點(diǎn),與N-糖基化激活位點(diǎn)可能位于后端堿基;牛HSPA6蛋白是一種主要由40.38%的α-螺旋和33.65%的無規(guī)卷曲組成的二級結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定的蛋白質(zhì),包含N-端核苷酸結(jié)合域和C-端多肽結(jié)合域兩個主要的結(jié)構(gòu)域,主要在細(xì)胞質(zhì)中發(fā)揮作用;蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建結(jié)果顯示,牛HSPA6蛋白主要與BAG1、DNAJA4、DNAJB1、DNAJC2等蛋白發(fā)生互作,參與腺苷酸交換因子活性、ATP酶調(diào)節(jié)活性、伴侶綁定等,表明牛HSPA6蛋白在牛機(jī)體能量代謝等過程中發(fā)揮潛在生物學(xué)功能。這些多重生物信息學(xué)分析為深入探討牛HSPA6蛋白對肉品質(zhì)的影響機(jī)制提供了理論依據(jù)。
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