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基于高通量測序分析蝦夷扇貝柱菌群結(jié)構(gòu)及腐敗優(yōu)勢菌
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 151 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 江艷華,王聯(lián)珠,許東勤,李風(fēng)鈴,翟毓秀,張媛,姚琳
關(guān)鍵詞: 蝦夷扇貝柱|高通量測序|菌群多樣性|腐敗優(yōu)勢菌
摘要:

為揭示蝦夷扇貝柱的菌群結(jié)構(gòu)及腐敗優(yōu)勢菌,通過對宏基因組DNA進行高通量測序,分析蝦夷扇貝柱新鮮和腐敗樣品的菌群結(jié)構(gòu),同時對可培養(yǎng)細菌菌群基因組DNA進行高通量測序,分析新鮮和腐敗樣品可培養(yǎng)細菌菌群的結(jié)構(gòu)特征。結(jié)果表明,對宏基因組測序后獲得的新鮮蝦夷扇貝柱中細菌菌群多樣性豐富,其中相對豐度較高的有Candidatus kuenenia(10.73%)、弧菌屬(Vibrio,8.15%)、別弧菌屬(Aliivibrio,7.38%)、芽孢桿菌屬(Bacillus,7.20%)和未分類菌(unclassified,16.08%);4?℃的腐敗優(yōu)勢菌為發(fā)光桿菌屬(Photobacterium,46.91%)、別弧菌屬(36.82%)和假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonas,11.01%),15?℃的腐敗優(yōu)勢菌為發(fā)光桿菌屬(46.97%)和別弧菌屬(43.33%),25?℃的腐敗優(yōu)勢菌為發(fā)光桿菌屬(41.94%)、別弧菌屬(23.10%)、梭桿菌屬(Fusobacterium,18.61%)和乳酸菌屬(Lactobacillus,10.60%)。對可培養(yǎng)細菌菌群基因組測序后發(fā)現(xiàn),新鮮樣品可培養(yǎng)細菌菌群多樣性大大降低,大部分為假交替單胞菌屬(89.46%),在25?℃腐敗后,可培養(yǎng)的腐敗優(yōu)勢菌為弧菌屬(50.98%)、希瓦氏菌屬(Shewanella,17.43%)和乳酸菌屬(10.68%)。本研究揭示了蝦夷扇貝柱新鮮及腐敗樣品的菌群結(jié)構(gòu)特征及腐敗優(yōu)勢菌,為進一步研究微生物對蝦夷扇貝柱品質(zhì)劣化的作用機制提供一定參考。

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