為了了解來自全球的副溶血弧菌環(huán)境菌株的群組結構和克隆復合體構成,利用PubMLST公共數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù),篩選其中具有完整序列分型(sequence type,ST)及肽序列型(peptide sequence type,pST)的來自全球的副溶血弧菌環(huán)境菌株數(shù)據(jù),進行亞群分析和克隆復合體分析,并分別構建了基于ST型和pST型的最小生成樹。結果表明,從數(shù)據(jù)庫中共篩選到具有ST型及pST型的來自全球的副溶血弧菌環(huán)境菌株數(shù)據(jù)886 條,共含有663 個ST型,以ST3型為最多,但也僅含27 條菌株信息。其中,有436 條菌株數(shù)據(jù)來自中國(包括大陸、香港和臺灣),覆蓋了410 個ST型,每個ST型含1~4 條菌株數(shù)據(jù),這436 條菌株數(shù)據(jù)又可分為128 個pST型,其中pST1型為最多,達116 條菌株數(shù)據(jù)。利用eBURST軟件對數(shù)據(jù)進行分析,共發(fā)現(xiàn)了73 個組,483 個單體。STRUCTURE軟件分析顯示來自全球的副溶血弧菌環(huán)境菌株的適宜亞群數(shù)為4,各亞群內(nèi)的樣品平均距離為0.981 7。綜上結果表明,來自全球的副溶血弧菌環(huán)境菌株具有高度多態(tài)性,可更細分為4 個亞群,MLST分型時以ST3型為多,AA-MLST分型時以pST1型為主。
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