本研究分別運(yùn)用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate-polyacrylamidegelelectrophoresis,SDS-PAGE)、紫外光譜、氨基酸分析、質(zhì)譜和分子信息技術(shù),比較中國(guó)山豬心肌高鐵肌紅蛋白(pig metmyoglobin,pMetMb)分子信息和三維結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:pMetMb肽鏈至少含有133 種氨基酸組分,但較hMb缺少脯氨酸(Pro)和精氨酸(Arg);與美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for BiotechnologyInformation,NCBI)數(shù)據(jù)庫(kù)豬野生型gi|494385比對(duì),其匹配度79.7%(置信度100%),故推測(cè)肽鏈長(zhǎng)度在133~153之間。pMetMb含有7 個(gè)α螺旋和2 個(gè)310螺旋,由于310螺旋存在(馬Mb沒(méi)有),使肽鏈中疏水基團(tuán)作用加強(qiáng),形成更加緊密盤疊的球狀亞基;第6和7螺旋的His64和His93的咪唑基團(tuán)N(Im N-)與Fe2+/Fe3+鍵合,構(gòu)成核心heme-Fe功能域;它鑲嵌于蛋白質(zhì)內(nèi)部疏水結(jié)構(gòu)內(nèi),更便于電子傳遞和Fe2+/Fe 3+氧化還原反應(yīng),維系肉色。
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