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PCR-DGGE法分析西藏傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌的多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 166 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 蔣厚陽,陳芝蘭,趙國華,楊吉霞
關(guān)鍵詞: 乳酸菌;生物多樣性;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和變性梯度凝膠電泳;系統(tǒng)進(jìn)化樹;優(yōu)勢(shì)菌種
摘要:

目的:運(yùn)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction- denatured gradient gelelectrophoresis,PCR-DGGE)技術(shù)分析西藏傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌的生物多樣性。方法:從西藏8個(gè)牧區(qū)采集19份樣品,提取樣品總DNA,用巢式和降落PCR擴(kuò)增16S rRNA的V3區(qū)段,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物做變性梯度凝膠電泳,用NTsys 2.10e軟件分析條帶的相似性,切膠回收條帶并測(cè)序,鑒定菌種并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹、分析優(yōu)勢(shì)菌種。結(jié)果:19份樣品中的乳酸菌菌群組成包括Lactobacillus paracasei、Lactobacillus helveticus、Lactobacillus fermentum、Lactobacillus crispatus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus buchneri、Lactococcus raffinolactis、Leuconostocmesenteroide、Lactobacillus plantarum、Pediococcus pentosaceus、Lactococcus lactis、Streptococcus thermophilus。綜合樣品和牧區(qū)的乳酸菌分布情況,確定Lactobacillus delbrueckii為優(yōu)勢(shì)菌種。結(jié)論:PCR-DGGE技術(shù)能夠有效分析西藏地區(qū)發(fā)酵乳制品中乳酸菌的多樣性。

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