領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
為高效利用蝦蟹殼資源，推動殼聚糖的幾丁質(zhì)脫乙酰酶法生產(chǎn)，采用Illumina測序技術(shù)，對1 株高產(chǎn)幾丁質(zhì)脫乙酰酶的紅球菌菌株11-3進行基因組測序，并進行系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析，主要包括基因本體論（Gene Ontology，GO）、直系同源群集（Cluster of Orthologous Group，COG）、京都基因與基因組百科全書（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）功能注釋，碳水化合物活性酶注釋以及幾丁質(zhì)降解相關(guān)酶基因的生物信息學(xué)分析。研究發(fā)現(xiàn)，紅球菌11-3的基因組為6 089 866 bp，共5 904 個編碼基因，GC含量為70.514%。經(jīng)碳水化合物活性酶注釋共識別了165 個基因，包括59 個碳水化合物酯酶基因，42 個糖基轉(zhuǎn)移酶基因，36 個糖苷水解酶基因和28 個輔助氧化還原酶基因，其中，鑒定出1 個幾丁質(zhì)脫乙酰酶基因（gene4907），4 個幾丁質(zhì)酶（EC 3.2.1.14）基因（gene1286、gene1287、gene3810、gene4754）和2 個殼聚糖酶（EC 3.2.1.132）基因（gene4921、gene5362）。gene4907與已報道的幾丁質(zhì)脫乙酰酶基因的序列一致性為26.60%～32.43%，為一種新的幾丁質(zhì)脫乙酰酶。因此，紅球菌11-3菌株在幾丁質(zhì)資源的開發(fā)領(lǐng)域具有極大潛力。
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