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基于全基因組測序解析貝萊斯芽孢桿菌產(chǎn)胞外多糖的分子基礎
來源:導入 閱讀量: 115 發(fā)表時間: 2024-11-08
作者: 梁悅琪, 張玉姣, 代藝偉, 陳映羲, 董亮, 張素芳
關鍵詞: 貝萊斯芽孢桿菌;全基因組測序;胞外多糖合成;基因
摘要:

本研究采用二代Illumina HiSeq與三代Pacbio平臺相結合的全基因組測序技術,對分離自郫縣豆瓣的產(chǎn)胞外多糖菌株貝萊斯芽孢桿菌(Bacillus velezensis)L-39進行全基因組測序。對B. velezensis L-39進行完整的基因組裝、預測、注釋、次級代謝產(chǎn)物合成基因簇和關鍵基因功能分析,重點關注其碳水化合物代謝、核苷糖合成途徑以及胞外多糖生物合成基因簇。結果顯示,B. velezensis L-39全基因組大小為3 970 591 bp,共編碼3 770 個基因。通過京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫進行途徑分析,在基因組中預測出一條eps基因簇和32 個功能基因,繪制出一條完整的胞外多糖合成通路。在此基礎上對關鍵基因進行了聚合酶鏈式反應擴增驗證,結果與預期相符。本研究旨在發(fā)掘與該菌株胞外多糖合成密切相關的基因,為深入解析其胞外多糖產(chǎn)生的分子基礎和實際應用開發(fā)提供科學依據(jù)。

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