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13 種河豚魚CO I基因部分DNA序列分析及在物種鑒定中的應用
來源:食品科學網 閱讀量: 159 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 陳文炳,繆婷玉,翁國柱,陳融斌,邵碧英,彭娟,江樹勛
關鍵詞: 河豚魚|CO I基因|DNA條形碼|物種鑒定
摘要:

應用CO I基因聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)擴增通用引物,對福建省和海南省搜集的3?屬13?種河豚魚樣品與9?個未知種名的河豚魚樣品的CO?I基因靶序列片段進行PCR擴增和測序,13?個已知物種樣品的DNA序列提交基因庫(GenBank),取得相應的登錄號。各物種CO I基因靶序列長度均為681 bp。應用DNAMAN V6軟件對樣品的DNA序列進行同源性比對分析,建立樣品間系統(tǒng)關系同源樹。基于CO I基因序列,供試13 個樣品被劃分為4?個類群組。群間的同源率為84%,群內同源率為90%~100%。根據序列同源性分析結果,9?個未知種名的樣品被歸類到2?個類群組中,判定這9?個樣品為東方鲀屬或腹刺鲀屬,其中1?個樣品(HNW2)為月腹刺鲀,4?個樣品(HNW3、HNW4、FJW2、FJW5)為棕斑腹刺鲀,1?個樣品(HNW1)為暗鰭腹刺鲀;3?個樣品(FJW1、FJW3、FJW4)為橫紋東方鲀。探討基于DNA條形碼技術的CO I基因靶序列片段在河豚魚種屬鑒別中應用的可能性。

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