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基于高通量測序的南美白對蝦中微生物群落分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 173 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 鄧曉影,張賓,湯賀,郝桂娟,章樣揚(yáng)
關(guān)鍵詞: 南美白對蝦|表面微生物|高通量測序|菌群分析
摘要:

目的:分析不同狀態(tài)下南美白對蝦表面附著的微生物菌群組成情況。方法:以活體對蝦、冰鮮對蝦、冰鮮蝦仁和冷凍蝦仁為對象,通過對蝦表面附著微生物提取及高通量測序分析,獲得不同對蝦樣品中微生物組成及變化情況。結(jié)果:1)各樣本有效序列范圍為30?591~42?043?條、操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)范圍為68~168,其中冷凍蝦仁OTU數(shù)量最低,而活體對蝦和冰鮮對蝦OTU數(shù)量相對較高。2)多樣性指數(shù)分析發(fā)現(xiàn),所有樣品中以冷凍蝦仁的ACE、Chao1和Shannon指數(shù)值最低、Simpson指數(shù)最高,表明其菌群豐度及多樣性較低。3)在科水平上,相比于活體對蝦,冰鮮對蝦中莫拉氏菌科(Moraxellaceae)相對豐度顯著增加,其可能與蝦體死亡、微生物污染繁殖有關(guān);冰鮮蝦仁弧菌科(Vibrionaceae)相對豐度顯著增加且含量最高,主要是蝦仁加工制備環(huán)境及加工器具中微生物接觸污染所致;而冷凍蝦仁中主要以莫拉氏菌科(Moraxellaceae)、假單胞菌科(Pseudomonadaceae)、李斯特菌科(Listeriaceae)為腐敗優(yōu)勢菌。4)熱圖分析發(fā)現(xiàn),活體對蝦和冰鮮對蝦菌群結(jié)構(gòu)整體相似度較高,二者與冰鮮蝦仁、冷凍蝦仁的相似度較低,表明蝦仁制備過程、低溫凍藏對于蝦仁中菌群結(jié)構(gòu)影響較大。5)主成分分析表明,冷凍蝦仁與其他組別樣本均相距較遠(yuǎn),說明冷凍蝦仁中微生物種類及組成與其他樣品存在著較大差異。結(jié)論:南美白對蝦樣品處于不同狀態(tài)時(shí),其附著優(yōu)勢微生物、菌群結(jié)構(gòu)、豐度及相互比例等存在顯著差異,需針對于不同類型蝦類制品,采取不同的控制工藝以保障蝦類制品的質(zhì)量與安全。

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