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利用高通量測序技術(shù)分析民間面引子中的真菌多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 165 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 劉建利,孫敏,曹曉虹,張琇,李靖宇
關(guān)鍵詞: 高通量測序|面引子|真菌群落
摘要:

面引子是傳統(tǒng)面食加工中發(fā)酵劑,以前對其微生物的研究大多集中于分離培養(yǎng)法,本實(shí)驗(yàn)旨在采用新一代高通量測序技術(shù)揭示傳統(tǒng)面引子中的真菌群落結(jié)構(gòu)特征。從我國不同地區(qū)收集18?個(gè)民間面引子樣品,基于宏基因組采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增ITS1區(qū),Illumina?Miseq測序,云平臺分析樣品中真菌群落。結(jié)果表明:18?個(gè)樣品中發(fā)現(xiàn)101?個(gè)操作分類單元,屬于真菌界4?個(gè)門、9?個(gè)綱、15?個(gè)目、25?個(gè)科、38?個(gè)屬、56?個(gè)種;釀酒酵母是大多數(shù)樣品中的優(yōu)勢菌;釀酒酵母、Fungi?sp.、unclassified_k__Fungi這3?個(gè)種在所有樣品中都存在,而且數(shù)量較大;Kazachstania bulder、戴爾凱氏有孢圓酵母、矮小假絲酵母、光滑假絲酵母菌、清酒假絲酵母這5?個(gè)種數(shù)量較大,但只在單個(gè)樣品中出現(xiàn);異常威克漢姆酵母、Alternaria?sp.和帚狀曲霉數(shù)量相對多一些,出現(xiàn)頻率較高,在絕大多數(shù)樣品中都有分布。各樣品真菌群落結(jié)構(gòu)相差不大,而且類型和地理分布差異也不明顯。

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