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瑞士乳桿菌調(diào)控小鼠腸道菌群變化規(guī)律的研究
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 194 發(fā)表時(shí)間: 2018-01-08
作者: 臧凱麗,賈 彥,崔文靜,馬新穎,王 泳,趙林森,趙 培,葉 雷,閻亞麗,陳慶森
關(guān)鍵詞: 瑞士乳桿菌TS206;腸道菌群;Ion torrent個(gè)人化操作基因組測(cè)序技術(shù);生物信息學(xué);多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
摘要:

為探究瑞士乳桿菌(Lactobacillus helveticus)TS206對(duì)小鼠腸道菌群的調(diào)控規(guī)律,更好地闡述益生菌維持 腸道菌群穩(wěn)態(tài)的機(jī)制,本研究以雄性BALB/c小鼠為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,將其分為L(zhǎng). helveticus TS206組、對(duì)照組、空白組。 L. helveticus TS206組和對(duì)照組分別每天灌胃L. helveticus TS206菌懸液和等量的生理鹽水,連續(xù)灌胃7 周,空白組 不灌胃。每周采集小鼠新鮮糞便樣品,通過試劑盒提取糞便細(xì)菌總DNA,利用Ion torrent個(gè)人化操作基因組測(cè)序 平臺(tái)測(cè)序技術(shù)對(duì)16S rRNA基因的V6區(qū)進(jìn)行高通量測(cè)序,最后通過生物信息學(xué)和多變量統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn) 行分析。結(jié)果顯示:所有測(cè)序序列在97%相似水平劃分得到1 617 個(gè)操作分類單位(operational taxonomic units, OTUs),被劃分為8 個(gè)門,硬壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)為各組小鼠中的優(yōu)勢(shì)菌門,占 總序列數(shù)的97.49%,且硬壁菌門豐度最高,超過70%;優(yōu)勢(shì)菌科主要為S24-7、毛螺菌科(Lachnospiraceae)、 瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)和擬桿菌科(Bacteroidaceae),且與對(duì)照組相比 L. helveticus TS206組腸桿菌科細(xì)菌數(shù)量較低并呈下降趨勢(shì)。經(jīng)LEfSe分析有53 個(gè)關(guān)鍵OTUs與2 組小鼠腸道糞便菌群 結(jié)構(gòu)顯著相關(guān),其中27 個(gè)OTUs在對(duì)照組中富集,分屬于腸桿菌科、瘤胃球菌科、毛螺菌科和梭菌目;26 個(gè)OTUs 在L. helveticus TS206組中富集,分屬于梭菌目、毛螺菌科和擬桿菌屬,其中與對(duì)照組相比,梭菌目豐度水平高。經(jīng) 主成分分析,兩組樣品完全分離,菌群的整體結(jié)構(gòu)存在差異,且富集的OTUs之間呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。綜上所述,在實(shí) 驗(yàn)階段,灌胃雄性BALB/c小鼠一定劑量的L. helveticus TS206后,經(jīng)擴(kuò)增子測(cè)序分析獲得的初步結(jié)論為L(zhǎng). helveticus TS206能改變腸道菌群整體結(jié)構(gòu)的功效,表現(xiàn)出了抑制腸道有害微生物生長(zhǎng)的作用,并通過促進(jìn)部分有益菌的增殖 來維持腸道菌群結(jié)構(gòu)的穩(wěn)態(tài)。

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