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苯甲酸及其類似物與酪氨酸酶分子對(duì)接研究
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 149 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 李慕紫,王慶華,王曉藝,何 云
關(guān)鍵詞: 酪氨酸酶;苯甲酸;抑制劑;分子對(duì)接
摘要:

以AutoDock 4.2和iGEMDOCK 2.1分子對(duì)接軟件對(duì)13 種苯甲酸類似物與酪氨酸酶進(jìn)行模擬對(duì)接研究,探討苯甲酸類似物對(duì)接結(jié)合自由能與實(shí)驗(yàn)測(cè)得的酶抑制活性的關(guān)系,并對(duì)分子對(duì)接結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果表明:AutoDock 4.2程序中Cu電荷數(shù)的設(shè)置對(duì)結(jié)合自由能有顯著影響,銅電荷數(shù)為2.0時(shí),苯甲酸類似物結(jié)合自由能和pIC50(-lgIC50)線性相關(guān)系數(shù)可達(dá)0.803 6。iGEMDOCK 2.1預(yù)測(cè)苯甲酸類似物的結(jié)果線性較差,即AutoDock 4.2較iGEMDOCK 2.1預(yù)測(cè)酪氨酸酶抑制劑的可靠性更高。

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