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深度測序技術(shù)檢測益生菌產(chǎn)品菌株組成及16S rDNA序列
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 199 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 楊捷琳,袁辰剛,竇同海,丁小磊,潘良文
關(guān)鍵詞: 乳酸菌;酸乳制品;16S rDNA;深度測序
摘要:

目的:探查益生菌制品的標(biāo)簽標(biāo)示與產(chǎn)品中實際檢測到的菌株比較及不同產(chǎn)品中菌株的異同性。方法:以市場上購買的進(jìn)口、出口酸乳制品作為研究對象,設(shè)計可區(qū)別24種產(chǎn)品的樣品標(biāo)簽序列(Barcode),通過PCR及Illumina平臺深度測序分析,獲得了酸乳制品中所含益生菌種類及序列等詳細(xì)信息,根據(jù)Barcode序列信息對其中所含的24個混合樣本進(jìn)行區(qū)分,然后利用16S RDP的16S數(shù)據(jù)庫,對測序的Reads進(jìn)行比對。結(jié)果:24種產(chǎn)品中標(biāo)簽標(biāo)示與樣品中實際檢測到的菌株完全一致的僅有兩種,在24種酸乳制品中,以嗜熱鏈球菌、嗜酸乳桿菌、保加利亞乳桿菌/德式乳桿菌為主要發(fā)酵菌株,雙歧桿菌作為添加的益生菌基本在所有樣品中存在,但含量較低,另一方面,不同產(chǎn)品中同一菌株的16S rDNA序列相似度較高,僅有兩種菌株的1~2個堿基存在差異。結(jié)論:深度測序是一種可快速有效對食品中微生物群體精確篩查的技術(shù),能夠精確深入了解食品中微生物群落。使用溶方法檢測目前市場上的酸乳制品,可發(fā)現(xiàn)使用的發(fā)酵菌種多來自商業(yè)化購買的菌劑,同質(zhì)化程度較高,而作為后添加的雙歧桿菌由于其生長條件的苛刻,實際活菌數(shù)量較低。

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