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基于高通量測序技術分析菜心切口處微生物多樣性
來源:食品科學網 閱讀量: 177 發(fā)表時間: 2022-05-30
作者: 家志文,陳學玲,范傳會,梅新,施建斌,隋勇,蔡沙,熊添,何建軍
關鍵詞: 菜心;微生物多樣性;高通量測序
摘要:

研究菜心冷藏期間的腐敗微生物,使用高通量測序技術,對冷藏菜心切口處微生物的多樣性進行分析,探究冷藏期間微生物菌群相對豐度的動態(tài)變化。以4 ℃冷藏菜心為研究對象,分析貯藏早期0 d、中期7 d、后期14 d的菜心切口處細菌的16S rRNA和真菌的ITS序列,比較各組菌群組成和豐度。通過物種注釋評估和物種組成分析,明確菜心貯藏過程中切口處的優(yōu)勢菌群。在貯藏早、中、后期,真菌優(yōu)勢菌群均為擔子菌門(Basidiomycota)、子囊菌門(Ascomycota)和unclassified Fungi。在貯藏早期,細菌優(yōu)勢菌群為厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria),而在貯藏中、后期,細菌優(yōu)勢菌群轉變?yōu)楹癖诰T、變形菌門、放線菌門(Actinobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)。微生物多樣性結果顯示,真菌的多樣性要高于細菌。本研究明確了菜心冷藏期間的微生物多樣性發(fā)生規(guī)律,為后續(xù)菜心保鮮劑和保鮮技術的研究提供了理論支撐。

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