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嗜水氣單胞菌拮抗芽孢桿菌抗菌素相關(guān)基因分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 170 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 曹海鵬,何珊,王會(huì)聰,呂利群
關(guān)鍵詞: 解淀粉芽孢桿菌|抗菌素相關(guān)基因|伊枯草菌素合成必需基因|系統(tǒng)發(fā)育分析
摘要:

分別對(duì)抗鱘源嗜水氣單胞菌的解淀粉芽孢桿菌G1的抗菌素相關(guān)基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增與測序,并對(duì)其編碼產(chǎn)物的氨基酸序列、跨膜螺旋信號(hào)、結(jié)構(gòu)域與二級(jí)結(jié)構(gòu)等進(jìn)行預(yù)測與分析。結(jié)果表明:菌株G1僅含有伊枯草菌素合成必需基因,該基因與GenBank基因庫中芽孢桿菌屬其他細(xì)菌的伊枯草菌素A、桿菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚類,與枯草芽孢桿菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98%的高度同源性,而且其編碼產(chǎn)物的氨基酸序列與GenBank中芽孢桿菌屬其他細(xì)菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽類化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物質(zhì)的氨基酸序列有高度同源性,與枯草芽孢桿菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登錄號(hào):ABY89499)的親緣關(guān)系最近。此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的編碼產(chǎn)物不具有明顯的跨膜結(jié)構(gòu),但其結(jié)構(gòu)域中存在AMP結(jié)合位點(diǎn)和PP結(jié)合位點(diǎn),二級(jí)結(jié)構(gòu)中存在α螺旋、伸展鏈、β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲。

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