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高通量測(cè)序分析沙棘酵素自然發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌多樣性
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 171 發(fā)表時(shí)間: 2022-05-30
作者: 張琪,朱丹,牛廣財(cái),顏飛翔,魏文毅,朱磊,王思溥
關(guān)鍵詞: 沙棘酵素;發(fā)酵;高通量測(cè)序;細(xì)菌群落
摘要:

為探尋沙棘酵素在自然發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性的變化,采用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)不同發(fā)酵時(shí)期的沙棘酵素液進(jìn)行細(xì)菌多樣性研究。結(jié)果表明:經(jīng)可操作分類(lèi)單元(operational taxonomic unit,OTU)分析共得到25 個(gè)門(mén),57 個(gè)綱,149 個(gè)目,239 個(gè)科,422 個(gè)屬,601 個(gè)種;在門(mén)水平上進(jìn)行群落組成分析,共得到5 種優(yōu)勢(shì)菌門(mén),分別為藍(lán)藻細(xì)菌門(mén)(Cyanobacteria)、變形菌門(mén)(Proteobacteria)、未知細(xì)菌菌門(mén)(unclassified_k__norank_d__Bacteria)、酸桿菌門(mén)(Acidobacteriota)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes),其中,Cyanobacteria為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌門(mén),在前期(F22_Q)、中期(F22_Z)和后期(F22_H)3 個(gè)發(fā)酵階段的相對(duì)豐度分別為93.28%、66.59%和35.40%;在屬水平上共有5 種優(yōu)勢(shì)菌,分別為norank_f__norank_o__Chloroplast、雷爾氏菌(Ralstonia)、unclassified_k__norank_d__Bacteria、norank_f__Mitochondria、Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia,其中,norank_f__norank_o__Chloroplast為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌屬,相對(duì)豐度范圍為35.39%~93.28%;通過(guò)樣本層級(jí)聚類(lèi)分析和主成分分析,3 個(gè)發(fā)酵階段可聚為兩類(lèi),前期(F22_Q)和中期(F22_Z)聚為一類(lèi),后期(F22_H)為一類(lèi)。本研究揭示了沙棘酵素自然發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌群落演替,為沙棘酵素發(fā)酵奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

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