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黃皮轉錄組測序及抗氧化相關基因的挖掘
來源:食品科學網 閱讀量: 187 發(fā)表時間: 2022-03-23
作者: 劉照宇,劉新婷,白新宇,李雯,曾教科
關鍵詞: 黃皮;抗氧化;轉錄組測序;差異表達基因
摘要:

為從分子水平研究黃皮果實抗氧化酶抑制褐變的機理,以熱激(heat treatment,HT)、程序降溫(low temperature conditioning,LTC)和對照(CK)組處理后3 ℃貯藏的黃皮果實為材料,研究溫度對黃皮果實褐變及抗氧化效果的影響,并應用轉錄組測序技術對黃皮果實RNA進行測序分析。結果表明:與CK相比,HT和LTC處理均可有效延緩黃皮果實采后褐變與失水,維持貯藏中后期較高的超氧化物歧化酶、過氧化物酶和過氧化氫酶等抗氧化酶活性,同時保持較高的1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基清除能力;貯藏第6天開始,LTC處理對黃皮果實的抗氧化效果顯著提高。轉錄組測序共35 421 個轉錄本;HT第6天和CK第6天相比篩選出1 631 個差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),LTC第6天和CK第6天相比篩選出5 404 個DEGs;基因本體論和京都基因與基因組百科全書富集分析表明,此類DEGs主要集中于植物激素信號轉導途徑、苯丙素生物合成和黃酮類化合物的生物合成途徑等,這些途徑均與植物的抗氧化/抗褐變相關。從已獲得的DEGs中篩選得出HT和LTC處理可能通過誘導第IV類、V類和X類抗氧化基因的表達,從而延緩黃皮果實褐變發(fā)生。研究結果為黃皮抗氧化相關基因挖掘和褐變調控提供理論數據支撐。

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