采用(NH4)2SO4鹽析和連續(xù)柱層析法從鱸魚(Lateolabrax japonicus)骨骼肌中分離純化了一種脯氨酰內(nèi)肽酶(prolyl endopeptidase,PEP)。通過(guò)液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜分析,得到43 個(gè)與紅鰭東方鲀的PEP高度一致的肽片段,證實(shí)該酶為PEP。以琥珀酰-甘氨酰-脯氨酸-4-甲基-7-香豆素為底物,確定PEP的最適pH 6.0和最適溫度35 ℃。溫度變化對(duì)PEP活力的影響較大,通過(guò)圓二色譜檢測(cè)顯示加熱對(duì)PEP的二級(jí)結(jié)構(gòu)有較為明顯的影響,且熱變性不可逆。通過(guò)分子克隆技術(shù)獲得PEP全長(zhǎng)cDNA開放閱讀框含2 226 個(gè)核苷酸,編碼741 個(gè)氨基酸殘基,預(yù)測(cè)分子質(zhì)量為84.12 kDa。通過(guò)同源建模得到鱸魚PEP的分子結(jié)構(gòu),PEP為典型的α/β水解酶折疊排列,其催化三聯(lián)體(His-711、Asp-672、Ser-585)被β-折疊形成的螺旋槳區(qū)域的中心通道所覆蓋。催化活性中心空間構(gòu)象穩(wěn)定對(duì)維持PEP活力至關(guān)重要,而其獨(dú)特的分子結(jié)構(gòu)是底物特異性的基礎(chǔ)。
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