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高通量測序分析不同腌臘肉制品細菌多樣性
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 151 發(fā)表時間: 2020-10-30
作者: 趙睿,邵長春,高世功,劉光瑞,楊富民
關(guān)鍵詞: 腌臘肉制品;高通量測序;傳統(tǒng)分離培養(yǎng);微生物群落結(jié)構(gòu)
摘要:

為掌握不同腌臘肉制品中微生物多樣性,采用16S V3-V4可變區(qū)域高通量測序結(jié)合傳統(tǒng)分離培養(yǎng)方式對產(chǎn)自不同地區(qū)不同加工方式的腌臘肉開展微生物菌相結(jié)構(gòu)研究。結(jié)果表明,通過傳統(tǒng)分離培養(yǎng)結(jié)合基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鑒定,共得到了99 株菌落,占比前3 位的菌株為腐生葡萄球菌(Staphylococcus saprophyticus)占比27.3%,大腸埃希菌(Escherichia coli)占比24.2%,馬葡萄球菌(S. equorum)占比14.1%,其余依次為類干酪乳桿菌(Lactobacillus paracasei)、清酒乳桿菌(L. sake)、屎腸球菌(Enterococcus faecium);13 批腌臘肉樣品經(jīng)高通量測序共獲得751 737 條有效序列,12 122 個操作分類單元;川渝煙熏臘肉菌落多樣性及豐富程度較低,與其他組相比差異顯著(P<0.05);微生物群落組成中優(yōu)勢菌門主要為厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinomycetes)、變形菌門(Proteobacteria);在屬水平上川渝煙熏臘肉葡萄球菌屬占87.33%~97.35%,湖南產(chǎn)煙熏臘肉則為7.76%~37.37%,甘肅隴西產(chǎn)非煙熏臘肉優(yōu)勢菌屬為嗜冷桿菌屬(Psychrophilus)、葡萄球菌屬、不動桿菌屬,浙江咸肉主要為不動桿菌屬占13.48%~32.51%;研究結(jié)果為掌握不同腌臘肉制品微生物多樣性提供了參考。

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