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基于培養(yǎng)基法和高通量測序法分析冷藏小龍蝦優(yōu)勢腐敗菌
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 138 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 江楊陽,楊水兵,余海霞,姚潔玉,胡亞芹
關(guān)鍵詞: 小龍蝦;優(yōu)勢腐敗菌;培養(yǎng)基法;高通量測序
摘要:

為揭示4 ℃冷藏小龍蝦貯藏期間微生物菌群多樣性及優(yōu)勢腐敗菌種類,以傳統(tǒng)培養(yǎng)基法作為對照,采用高通量測序技術(shù)分別鑒定小龍蝦樣品在鮮樣期、腐敗中期、腐敗末期的腐敗菌屬,探究貯藏期間微生物菌群變化趨勢。2 種測序方法對比發(fā)現(xiàn),高通量法檢測到的菌屬更具多樣性,培養(yǎng)基法提取的腐敗菌均包含在高通量測序菌屬內(nèi)。結(jié)果表明,培養(yǎng)基法提取優(yōu)勢腐敗菌共11 株,其中氣單胞菌(Aeromonas jandaei)致腐能力最強,弗氏檸檬酸桿菌(Citrobacter freundii)致腐能力最弱;此外,高通量測序法顯示希瓦氏菌(Shewanella sp.)、肉桿菌屬(Carnobacterium sp.)、環(huán)絲菌屬(Brochothrix sp.)、嗜冷菌屬(Psychrobacter sp.)、漫游球菌屬(Vagococcus sp.)、不動桿菌屬(Acinetobacter sp.)等在腐敗末期時的物種豐度為90.57%。2 種方法比對可以確定,小龍蝦的優(yōu)勢腐敗菌有希瓦氏菌、肉食桿菌、環(huán)絲菌屬、嗜冷菌屬、漫游球菌屬、不動桿菌屬、氣單胞菌、束毛球菌屬(Trichococcus sp.)等。

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