融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW21是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,為探索其抗菌機(jī)理,分析其全基因組序列并挖掘該菌株的抗菌等功能特性基因。本研究基于Illumina NovaSeq PE150平臺(tái)對(duì)W. confusa ZW21進(jìn)行全基因組測(cè)序分析,并采用基因功能、京都基因與基因組百科全書(shū)、蛋白質(zhì)直系同源簇、非冗余蛋白、碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫(kù)、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白分類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行基因組基本功能注釋。結(jié)果表明:W. confusa ZW21的基因組大小為2.44 Mb,GC含量45.66%;預(yù)測(cè)到2 175 個(gè)編碼基因,編碼基因總長(zhǎng)度為1 947 771 bp,平均長(zhǎng)度為896 bp;通過(guò)功能數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)該菌株基因組基本功能注釋和代謝通路基因信息注釋可知,基因組中含有8 種細(xì)菌素(如大腸菌素V和乳球菌素)相關(guān)基因、3 種與抗氧化活性相關(guān)基因,以及可調(diào)控免疫和炎癥信號(hào)通路(如核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體蛋白受體信號(hào)通路、過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體信號(hào)通路)和編碼抗葉酸的基因。綜上,W. confusa ZW21全基因組測(cè)序及分析為研究其抗菌機(jī)理提供基礎(chǔ)。
2023年第44卷 2022年第43卷 2021年第42卷 2020年第41卷 2019年第40卷 2018年第39卷 2017年第38卷 2016年第37卷 2015年第36卷 2014年第35卷 2013年第34卷 2012年第33卷 2011年第32卷 2010年第31卷 2009年第30卷 2008年第29卷 2007年第28卷 2006年第27卷 2005年第26卷 2004年第25卷 2003年第24卷 2002年第23卷 2001年第22卷 2000年第21卷 1999年第20卷 1998年第19卷 1997年第18卷 1996年第17卷 1995年第16卷 1994年第15卷 1993年第14卷 1992年第13卷 1991年第12卷 1990年第11卷 1989年第10卷 1988年第09卷 1987年第08卷 1986年第07卷 1985年第06卷 1984年第05卷 1983年第04卷 1982年第03卷 1981年第02卷 1980年第01卷
電話(huà): 010-87293157
地址: 北京市豐臺(tái)區(qū)洋橋70號(hào)
版權(quán)所有 @ 2023 中國(guó)食品雜志社 京公網(wǎng)安備11010602060050號(hào) 京ICP備14033398號(hào)-2