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基于比較基因組學(xué)的Clostridium kluyveri己酸代謝途徑關(guān)鍵酶生物信息學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 131 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 徐友強(qiáng),孫寶國(guó),蔣玥鳳,鹿發(fā)展,張成楠,鄒偉,王文華,楊然,滕超,范光森,李秀婷
關(guān)鍵詞: 白酒|Clostridium kluyveri|己酸|代謝途徑|硫解酶|比較基因組學(xué)
摘要:

對(duì)3?株白酒來源重要的己酸生產(chǎn)菌株Clostridium kluyveri(NBRC 12016、JZZ和DSM 555)全基因組信息進(jìn)行比較基因組學(xué)分析,聚焦于己酸代謝途徑核心催化酶,發(fā)現(xiàn)NBRC 12016的己酸代謝途徑未得到有效注釋,JZZ的己酸代謝途徑核心催化酶酰基輔酶A脫氫酶存在注釋錯(cuò)誤。進(jìn)一步對(duì)C. kluyveri模式菌株DSM 555己酸代謝途徑的關(guān)鍵酶硫解酶ThlA進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)DSM 555攜帶3 拷貝的ThlA,且具有序列多態(tài)性,可能與催化脂肪酸代謝鏈延長(zhǎng)的底物特異性相關(guān)。結(jié)構(gòu)分析和分子對(duì)接表明,硫解酶ThlA1的底物催化屬于氧化還原開關(guān)調(diào)控機(jī)制,并預(yù)測(cè)了酶的關(guān)鍵催化位點(diǎn)和具體的催化過程。上述分析結(jié)果有助于為后續(xù)進(jìn)一步改進(jìn)菌株的己酸生產(chǎn)性能和更好地應(yīng)用于白酒釀造提供依據(jù)。

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