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鋅螯合肽的兩端排序法定量構(gòu)效關(guān)系
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 122 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 黃晶晶,余 敏,馬 敏,鄢 嫣,張福生,殷俊峰,謝寧寧
關(guān)鍵詞: 菜籽源|鋅螯合肽|定量構(gòu)效關(guān)系
摘要:

為了研究鋅螯合肽結(jié)構(gòu)與生物活性之間的關(guān)系,構(gòu)建定量構(gòu)效關(guān)系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型。采取兩端排序法將56 條不同長(zhǎng)度的合成肽規(guī)格化,采用18 種氨基酸描述符,利用偏最小二乘法進(jìn)行分析。發(fā)現(xiàn)5 種氨基酸描述符對(duì)應(yīng)的QSAR模型的相關(guān)系數(shù)達(dá)到建模要求,分別為描述符FASGAI、Z、HESH、C和ST,其中描述符FASGAI最優(yōu)(R2=0.827 3、Q2=0.602 2、估計(jì)均方根誤差=0.168 6、Q2ext=0.717 2、預(yù)測(cè)方根誤差=0.255 8)。對(duì)描述符FASGAI所構(gòu)建的模型進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),多肽序列中的氨基酸位置對(duì)多肽鋅螯合活性的影響力依次為C3>N3>C1>N1>N2>C2,同時(shí),多肽各位置上氨基酸殘基的立體屬性會(huì)影響其螯合活性。該模型的成功建立為鋅螯合肽定量構(gòu)效關(guān)系的研究提供了探索性思路。

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