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基于基因組學(xué)分析嗜熱鏈球菌KLDS SM的蛋白質(zhì)水解系統(tǒng)和氨基酸合成途徑
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 150 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 李柏良,丁秀云,靳妲,劉飛,蒙月月,李娜,趙莉,霍貴成
關(guān)鍵詞: 嗜熱鏈球菌|基因組|生物信息分析|蛋白質(zhì)水解|氨基酸合成
摘要:

為從遺傳水平上探究嗜熱鏈球菌KLDS SM蛋白質(zhì)水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500與Pacbio RSII測(cè)序平臺(tái)對(duì)嗜熱鏈球菌KLDS SM進(jìn)行全基因組測(cè)序并繪制基因組圖譜;隨后從胞外蛋白酶、轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)、胞內(nèi)肽酶以及氨基酸合成等方面所涉及的基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析;最后對(duì)15?株已完成全基因組測(cè)序的嗜熱鏈球菌的氨基酸合成能力進(jìn)行比較基因組學(xué)研究。結(jié)果表明:菌株KLDS?SM的基因組由一個(gè)1?856?787?bp環(huán)狀染色體組成,GC含量為39.08%,含有1?732?個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因;菌株KLDS?SM具有完整的蛋白水解系統(tǒng)和8?種氨基酸的合成能力;15?株嗜熱鏈球菌在氨基酸合成方面上相對(duì)保守,僅在組氨酸合成途徑存在較大的差異。本研究為該菌株氮代謝能力的挖掘提供了理論依據(jù),并在將其開發(fā)為發(fā)酵劑方面上具有一定指導(dǎo)意義。

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