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短乳桿菌天然質(zhì)粒分類
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 148 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 孫大慶,李洪飛,楊健,宋大巍
關(guān)鍵詞: 短乳桿菌|質(zhì)粒|復(fù)制起始蛋白|基因組共線性|復(fù)制子
摘要:

為建立短乳桿菌天然質(zhì)粒分類方法,通過(guò)質(zhì)粒復(fù)制起始蛋白(replication initiation protein,Rep)進(jìn)化樹(shù)和基因組共線性分析,將短乳桿菌51 個(gè)天然質(zhì)粒可以準(zhǔn)確、有效地劃分為6?個(gè)家族類型和11?個(gè)亞家族類型,并在家族4質(zhì)粒中發(fā)現(xiàn)了一種新的復(fù)制子類型。研究結(jié)果表明,質(zhì)粒Rep進(jìn)化樹(shù)和基因組共線性分析都是短乳桿菌天然質(zhì)粒有效的分類方法,分類結(jié)果為今后短乳桿菌天然質(zhì)粒科學(xué)分類和理性應(yīng)用提供了理論研究依據(jù)。

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