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多基因DNA條形碼鑒定6 個鰻魚物種
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 112 發(fā)表時間: 2018-01-08
作者: 陳文炳,邵碧英,繆婷玉,彭娟,陳彬,張志燈,江樹勛
關(guān)鍵詞: 16S?rRNA基因;Cyt b基因;COⅠ基因;多基因DNA條形碼;鰻魚物種鑒定
摘要:

建立6?種鰻魚的物種多基因DNA條形碼精準(zhǔn)鑒定方法。以鰻魚DNA為模板,采用3?對通用引物對6?種鰻魚的3?個基因(16S rRNA、Cyt b、COⅠ)部分DNA片段進行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴增、測序,結(jié)果6?種鰻魚各獲得3?條16S rDNA(638~643?bp)、Cyt?b(464~466?bp)、COⅠ(705~707?bp)基因部分DNA序列,從中選取各物種序列同源的片段設(shè)計3 對新引物對6 種鰻魚的16S rRNA、Cyt b、COⅠ基因部分DNA片段進行PCR擴增,其產(chǎn)物大小分別為504~507、400、609?bp,再從各片段中篩選出具有6?種鰻魚物種特異性強的、堿基數(shù)分別為262、280、300?bp的3?條DNA片段序列,作為6?種鰻魚物種的3?個基因的標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼,應(yīng)用DNAMAN?V6軟件進行同源性分析,并通過GenBank數(shù)據(jù)庫的比對驗證,制定了供檢測實踐用的同源率判別指標(biāo),建立鰻魚物種的多基因條形碼檢測方法。應(yīng)用該方法對30?個待檢鰻魚樣品進行檢測,結(jié)果表明,各樣品基于3?個基因DNA條形碼的比對,符合同源率指標(biāo),物種判別結(jié)果互相吻合,從而精準(zhǔn)判別樣品的所屬物種。該方法穩(wěn)定、精準(zhǔn)、易于操作,可應(yīng)用于6?種鰻魚的物種鑒定,值得推廣。

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