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植物乳桿菌LY-78乳酸脫氫酶基因的生物信息學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 148 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 李 芬,孫大慶,張麗萍,
關(guān)鍵詞: 植物乳桿菌;乳酸脫氫酶;苯乳酸;生物信息學(xué)
摘要:

目的:探究植物乳桿菌LY-78菌株全部5 個(gè)乳酸脫氫酶基因及其編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能。方法:應(yīng)用多種生物信息學(xué)軟件對植物乳桿菌LY-78菌株的5 個(gè)乳酸脫氫酶基因及氨基酸序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析和功能預(yù)測。結(jié)果:植物乳桿菌LY-78中5 個(gè)乳酸脫氫酶的核苷酸及氨基酸序列均具有較高的保守性,均為位于細(xì)胞質(zhì)的熱穩(wěn)定性、非分泌、非跨膜蛋白,除了ldhL3基因,其余4 個(gè)基因均具有各自高度保守的功能位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)域,均存在典型的煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD+)結(jié)合位點(diǎn)序列GXGXXG。結(jié)論:乳酸脫氫酶D1(D1-lactate dehydrogenase,D1-LDH)、D2-LDH、L1-LDH及L2-LDH均具有完整的功能位點(diǎn)和結(jié)構(gòu)域,很可能具有真正的乳酸脫氫酶活性,L3-LDH由于缺失NAD+結(jié)合結(jié)構(gòu)域和功能位點(diǎn),因而可能不具有乳酸脫氫酶活性,這些分析結(jié)果為今后植物乳桿菌乳酸脫氫酶基因改造和苯乳酸合成代謝機(jī)制研究提供了必要的理論基礎(chǔ)。

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