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出入境動物源性食品中單增李斯特菌的多位點序列分型分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 198 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 劉二龍,袁慕云,鄧建英,幸 芳,呂英姿,蔣 原,薛 峰,邵景東,許龍巖,
關(guān)鍵詞: 單增李斯特菌;多位點序列分型;親緣關(guān)系
摘要:

對出入境動物源性食品中分離的單增李斯特菌進行多位點序列分型(mutilocus sequence typing,MLST)分析,了解其序列型分布特點及不同菌株之間的親緣關(guān)系。提取單增李斯特菌基因組DNA,選擇其7 個管家基因進行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴增并測序。將測序結(jié)果截成標(biāo)準(zhǔn)序列的長度后上傳到MLST數(shù)據(jù)庫進行比對分析,獲得7 個管家基因的等位基因譜和序列分型編碼,并將結(jié)果采用不加權(quán)算術(shù)平均組對(unweighted pair group method usingarithmetic averages,UPGMA)法進行聚類分析。89 株單增李斯特菌共獲得51 個STs,其中26 個為新獲得的STs(STnew1~STnew26);數(shù)量最多的5 個STs為ST8(9.0%),ST121(9.0%)、ST7(5.6%)、ST87(5.6%)及新發(fā)現(xiàn)的STnew3(7.8%);其中ST456、ST34、ST343、ST19、ST517、ST201、ST98、ST330和ST73為在國內(nèi)首次獲得。采用UPGMA算法得到的進化樹可將89 株菌株分為3 大類群,分類的結(jié)果與單增李斯特菌血清學(xué)家系分類結(jié)果一致。MLST結(jié)果對了解出入境動物源性食品中分離的單增李斯特菌的親緣關(guān)系及流行病學(xué)溯源有重要意義。

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