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PCR-DGGE分析甘薯酸漿自然發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌多樣性
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 122 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 鄭 艷,姚 婷
關(guān)鍵詞: 甘薯酸漿;變性梯度凝膠電泳;優(yōu)勢(shì)菌種;系統(tǒng)進(jìn)化樹;絮凝微生物
摘要:

以不同發(fā)酵階段的甘薯酸漿為研究對(duì)象,采用變性梯度凝膠電泳技術(shù)(denaturing gradient gelelectrophoresis,DGGE)分析甘薯酸漿發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌的多樣性。提取樣品總DNA,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerasechain reaction,PCR)擴(kuò)增16S rDNA的高變區(qū)序列,再通過(guò)變性梯度凝膠電泳得到特異性條帶并對(duì)其進(jìn)行序列分析及比對(duì)。結(jié)果表明:甘薯酸漿自然發(fā)酵過(guò)程中,主要以厚壁菌門(Firmicutes)和變形菌門(Proteobacteria)的明串珠菌屬(Leuconostoc)、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、Reyranella屬、泛菌屬(Pantoea)、克羅諾桿菌屬(Cronobacter)以及螺菌屬(Spiriiium)的細(xì)菌為主;此外,還有擬桿菌門中黃桿菌屬(Flavobacterium)以及藍(lán)細(xì)菌中的色球藻屬(Chroococci)的細(xì)菌參與其中。相似性分析結(jié)果表明,自然發(fā)酵甘薯酸漿中的菌群結(jié)構(gòu)有很大相似性,其中最大相似度為88.5%,最小相似度為71.4%。

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