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—— 中國食品雜志社
為全面了解Paenarthrobacter ilicis CR5301的遺傳背景，深入解析CR5301轉(zhuǎn)化萊鮑迪甙C（rebaudioside C，RC）的關鍵酶，采用二代Illumina HiSeq和三代Nanopore相結(jié)合的測序方法，對CR5301進行全基因組測序和關鍵酶預測分析。結(jié)果顯示，CR5301基因組為1 個閉合環(huán)狀染色體DNA分子，不含質(zhì)粒，基因組序列全長4 748 281 bp，GC含量62.92%，共編碼4 458 個基因，同時含有4 個基因島、1 個前噬菌體和14 個CRISPR-Cas編碼序列。CR5301是P. ilicis物種第1個測定基因組完成圖的菌株，也是Paenarthrobacter菌屬已知基因組最大的菌株。基因組共線性分析和16S rRNA基因系統(tǒng)進化樹分析結(jié)果一致表明，P. ilicis CR5301與P. aurescens具有更近的親緣關系，而與P. ureafaciens的親緣關系較遠。7 個蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫綜合注釋分析發(fā)現(xiàn)，P. ilicis CR5301基因組共含有523 個碳水化合物活性酶基因，其中18 個糖苷酶基因可能是CR5301轉(zhuǎn)化RC的關鍵酶基因。最后，通過ProtParam、SOPMA生物信息學軟件，預測了18 個糖苷酶的物化性質(zhì)和二級結(jié)構(gòu)。這些結(jié)果為CR5301的RC轉(zhuǎn)化機制研究提供了清晰、完整的遺傳信息，并且為P. ilicis物種廣泛的生物學研究提供了完整、可靠的參考基因組序列，對今后P. ilicis物種生物學研究具有重要的參考價值和普遍的借鑒意義。
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