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橄欖苦苷改善db/db小鼠糖尿病的肝臟轉(zhuǎn)錄組學(xué)及生物信息學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 193 發(fā)表時間: 2022-10-24
作者: 鄭淑娟,謝子鑫,方靖靖,王亞楠,耿睿璇,趙雨菡,李夢杰,仝濤,黃昆侖
關(guān)鍵詞: 橄欖苦苷;轉(zhuǎn)錄組;差異表達(dá)基因;功能注釋;磷酸肌醇3-激酶-蛋白激酶B信號通路
摘要:

通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其生物信息學(xué)分析,研究了橄欖苦苷緩解db/db小鼠糖尿病的肝臟差異表達(dá)基因及相關(guān)信號通路。結(jié)果發(fā)現(xiàn)與db/db對照組相比,橄欖苦苷處理組的539 個基因發(fā)生顯著變化,其中450 個基因顯著上調(diào),89 個基因顯著下調(diào)。將上調(diào)和下調(diào)的差異表達(dá)基因在基因本體論數(shù)據(jù)庫中注釋,這些差異表達(dá)基因主要在細(xì)胞過程、細(xì)胞部分和結(jié)合中分布。京都基因與基因組百科全書通路富集分析結(jié)果顯示上調(diào)的差異表達(dá)基因主要富集在磷酸肌醇3-激酶-蛋白激酶B信號通路途徑,該通路共涉及27 個差異表達(dá)基因;下調(diào)的差異表達(dá)基因主要富集在花生四烯酸代謝和真核生物中核糖體的生物發(fā)生信號通路途徑,分別涉及4 個差異表達(dá)基因。本研究為進(jìn)一步闡明橄欖苦苷緩解2型糖尿病的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

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