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植物乳桿菌P8亞油酸異構(gòu)酶基因及其上游非編碼區(qū)的克隆與分析
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 179 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 張昕艷,趙國芬,張和平,包秋華
關(guān)鍵詞: 植物乳桿菌|亞油酸異構(gòu)酶|克隆|生物信息學
摘要:

依據(jù)GenBank中已公布的亞油酸異構(gòu)酶基因,設(shè)計一對特異性引物,PCR擴增該基因后,克隆到T載體上并轉(zhuǎn)化到Trans1-T1感受態(tài)細胞中。經(jīng)菌落PCR鑒定和序列分析表明,亞油酸異構(gòu)酶基因大小為1720bp。該基因與植物乳桿菌AS1.555(DQ227322)的同源性達到99%,與泡菜植物乳桿菌(DQ010331)的同源性達到89%。該基因序列在GenBank上注冊,編號為HM569265,對其進行生物信息學分析發(fā)現(xiàn),基因中含有一段低復雜性區(qū)域。分析乳酸桿菌(CP001617)基因組全序列,設(shè)計了亞油酸異構(gòu)酶基因上游非編碼區(qū)805bp片段的特異性引物,PCR擴增該片段后將其克隆到T載體上并轉(zhuǎn)化到Trans1-T1感受態(tài)細胞中。經(jīng)菌落PCR鑒定后,進行序列分析和生物信息學的初步分析,預測出該片段中有12個基序,以及6個轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件。

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