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新疆兩種亞麻籽轉(zhuǎn)錄組分析及籽油香氣差異基因挖掘
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 231 發(fā)表時間: 2022-03-23
作者: 楊佳瑋,李歡康,林雨霏,劉文玉,魏長慶
關鍵詞: 亞麻籽;轉(zhuǎn)錄組;差異表達基因;功能注釋
摘要:

為豐富亞麻籽轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息,在分子水平上探究不同品種亞麻籽所得亞麻籽油的香氣差異原因,本研究選擇2 種新疆特色亞麻籽(伊亞-3號和天亞-6號),通過Illumina高通量測序平臺對其進行轉(zhuǎn)錄組測序,并通過多種生物信息學方法對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。結果表明:共獲得61 995 756 條高質(zhì)量的clean reads,將測序數(shù)據(jù)進行de novo組裝得到33 218 個unigene;非冗余蛋白(Non-Redundant Protein,NR)數(shù)據(jù)庫注釋發(fā)現(xiàn)亞麻籽轉(zhuǎn)錄組與麻風樹相似序列最高,有17 269 個unigene在直系同源群集(Cluster of Orthologous Group,COG)數(shù)據(jù)庫中注釋到,分為細胞過程和信號、信息存儲與處理、代謝3 大類22 個分支;兩組樣品分析顯示有1 658 個顯著性差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs),伊亞-3號相較于天亞-6號亞麻籽樣品共有825 個基因上調(diào)表達,833 個基因下調(diào)表達,將DEGs在基因本體數(shù)據(jù)庫中注釋顯示,兩個品種在生物過程、細胞組分和分子功能3 大類分布。注釋到京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫的380 個DEGs,主要富集到脂肪酸代謝等代謝途徑,且脂肪酸代謝通路中可注釋到17 個DEGs,其中不飽和脂肪酸代謝通路中可注釋到8 個DEGs。本研究可為新疆不同品種亞麻籽油的香氣差異分析提供理論依據(jù)和技術支撐。

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