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基于分子對(duì)接和表面等離子共振技術(shù)分析蝦青素與跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白CD36的結(jié)合作用
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 161 發(fā)表時(shí)間: 2023-07-10
作者: 張俊林,陳祉晴,鄭欽生,肖杰,曹庸,劉曉娟
關(guān)鍵詞: 蝦青素;白細(xì)胞分化抗原36;分子對(duì)接;表面等離子共振技術(shù)
摘要:

目的:探究蝦青素與跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白白細(xì)胞分化抗原36(cluster determinant 36,CD36)的結(jié)合作用。方法:采用分子對(duì)接技術(shù)模擬蝦青素與CD36的結(jié)合作用,結(jié)合算法獲得相互作用參數(shù),確定結(jié)合位點(diǎn),建立最佳匹配模型。同時(shí),利用表面等離子共振技術(shù)測(cè)定分子間相互作用的結(jié)合和解離常數(shù)。結(jié)果:蝦青素進(jìn)入CD36內(nèi)部的疏水腔中,對(duì)接結(jié)合能為-11.70 kcal/mol,且呈劑量依賴(lài)性結(jié)合,解離平衡常數(shù)KD為1.00×10-6 mol/L,表明蝦青素與CD36以高親和力結(jié)合,且動(dòng)力學(xué)曲線(xiàn)顯示蝦青素與CD36的結(jié)合模式為慢結(jié)合慢解離;蝦青素與CD36更多的氨基酸結(jié)合形成疏水相互作用,不同于葉黃素和β-胡蘿卜素與CD36的極性氨基酸Asn53形成弱的范德華力,蝦青素與天冬酰胺Asn53形成氫鍵作用,可能是蝦青素以高親和力結(jié)合CD36的部分原因,同時(shí)推斷蝦青素末端環(huán)上的酮基或羥基與酮基形成的α-羥基酮對(duì)于形成氫鍵起一定作用。結(jié)論:蝦青素與CD36發(fā)生自發(fā)的相互作用且以高親和力結(jié)合,結(jié)合模式為慢結(jié)合慢解離,從而實(shí)現(xiàn)有效的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)。

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